XSR 900 har en tresylindret 847-kubikks kraftkilde med Yamahas crossplane-teknologi. Motoren byr på lekne krefter gjennom hele registeret. Selv om den kan være from som et lam, trives den best med offensiv kjøring.
Da vi måler de faktiske verdiene på bakhjulet i bremsebenken, får vi frem maksimale 108,41 hestekrefter ved 10 000 rpm. Momentet lander på 83,38 Newtonmeter ved 8 400 rpm.